刘文典回忆说：“记得有一天下午，章先生正在拿佛学印证《庄子》，忽然听见巷子里卖号外，有一位同学买来一看，正是武昌起义的消息，大家喜欢得直跳起来。从那天起，先生学生天天聚会，但是不再谈《说文》《庄子》，只谈怎样革命了。”
章太炎于当年11月回到上海。他刚安顿下来，就以革命元勋、革命文豪的身份，发表许多言论，其中不少与孙中山等人的主张不同甚至相反。例如，黄兴等人打电报给他，请教关于扩大革命党的意见，他却回电说：“革命军起，革命党消，天下为公，乃克有济。今读来电，以革命党人召集革命党人，是欲以一党组织政府。若守此见，人心解体矣。诸君能战即战，不能战，弗以党见破坏大局。”
在革命的紧要关头，他却要取消革命党。因为他认为，党派是自私自利的产物，“党”这个字在古代汉语中，不是一个褒义词。搞革命，应该公平对待一切人，不能拉帮结派。这种想法，从理论上说，是高妙的、大公无私的，但在现实中就不免显得幼稚了。
在建立政府问题上，他的表现说明他对孙中山的意见仍然很大。他比孙中山回国早。南京克复后，有人提议，等孙中山回国后正式成立民国政府。章太炎发表宣言反对，字里行间流露出对孙的鄙视，他认为，革命过程中，孙中山躲得远远的，有什么资格回来当领袖？他自己当然也无意于此。
他心目中的人选是：黎元洪为元帅，黄兴为副元帅，宋教仁为内阁总理。黎是清军一个协统（旅长），革命思想并不充分，武昌起义，当革命党冲进他的宅邸时，他正浑身发抖地藏在床底下，被人们拉出来，不得已就任都督之职。章太炎却认为他是起义的首义者，资格最老。
但在广大民众心目中，孙中山才是真正的革命领袖。所以这年年底，孙中山回国，立即被推举为中华民国临时大总统，于次年元旦宣誓就职。章太炎心里不服气，所以对新政府态度相当冷淡。孙中山委任他为总统府枢密顾问，派人到上海接他。他根本没有合作之意，只到南京转了一圈，就写信说：“上海江宁，咫尺地耳，若有献替，邮书半日即至，无必常宿直庐也。”仍回上海居住。对新政府的号令，他也经常挑毛病，孙中山决定采用世界通行的公历纪年，他发了两通宣言表示反对，倒不是为了公历纪年不好，而是说这种改变应该先交国民讨论，经公选后实行，方合乎法律程序。
在建都问题上，章太炎也没有同孙中山站在一起。孙中山只当了三个月总统，因为军事实力弱于北洋军，被迫让位于答应逼清帝退位、同意建立民国的袁世凯。孙中山提出的条件之一是，民国必须建都南京，因为南方是革命党的根据地，可以形成对袁的监督。老谋深算的袁世凯当然不会就范，使出种种手段坚持建都北京。在南方代表赴北京进行紧张谈判的同时，章太炎却多次发表意见，主张以北京为首都。他的见解自有合理之处，如建都北京，可以防止清廷复辟，也可有效抵抗北方侵略，因为日俄一直是中国的两大隐患。他认为孙中山等坚持建都南京是出于自私心理，是在图谋禄位。
章太炎论事，自有偏激之处，但在对新政府的批评中，也有正确的意见。
临时政府初立，经费非常困难，孙中山和黄兴为了解燃眉之急，与日本私下订约，向其借贷巨款，以中日合资经营中国最大的煤铁公司汉冶萍公司为代价。在这个合同中，中国显然是吃亏的一方。章太炎知道此事后，立即将之公诸报端，指责孙中山不经议会讨论，就决定如此重大事件，是违反法律的行为。他为此多次致信孙中山，要求废除合约。这事一公开，遭到越来越多人的反对，终于使孙中山“毁合办之约”。
章太炎与同盟会和新政府最大的仇怨是为了陶成章之死。因为陶成章与孙中山素有隔阂，陶的光复会在江浙一带的革命斗争中起到相当大的作用，革命成功后，两派的矛盾没有缓和，反而更加严重。在光复上海的战斗中，两派各取城市的一半，出现两个都督共治的局面。结果民国成立刚半个月，陈其美派蒋介石到广慈医院刺杀了陶成章。虽然孙中山、黄兴事后都发了命令，要求缉拿凶犯，严厉惩处，但明眼人不难发现其中的奥妙。对章太炎来说，事件的根源更是昭然若揭。至此，他与同盟会完全决裂，每次开会，必大骂同盟会。说他们是一群道德败坏的人，自己羞于与他们为伍。有一次，南京召开四川革命烈士追悼大会，孙中山出席，章太炎不赴会，却叫人送来一副对联，道是：
群盗鼠窃狗偷，死者不瞑目；
此地龙蟠虎踞，古人之虚言。
革命胜利后，社会上各色人等“咸与革命”，使革命队伍鱼龙混杂，一些唯利是图的人乘机捞取好处。章太炎对革命者的道德要求很高，对这些现象自然看不顺眼。而对北方的袁世凯，因为离得远，以前又没有交往，所以倒多致赞辞，称之为一时“雄骏”，还上书数封，出谋献策。
袁世凯看到这位大文豪主动送上门来，欣喜万分，赶紧将章太炎任命为国府高等顾问，请入北京。
袁世凯老奸巨猾，章太炎心直口快。如果袁世凯隐藏得深一些，倒能骗骗这个书生。怎奈共事一久，人总不免露出本性。
有一件小事，让章太炎认识了袁世凯的真面目。1912年7月，章太炎去了一趟湖北，拜访了黎元洪。在与当地人的闲谈中，他听到人们对清末湖广总督张之洞的评价较高，说他派遣留学生，编练自强军，培养了大批人才，对湖北的发展做出了一定的贡献，在全国也是很先进的。章太炎在张之洞幕府中待过一段，结果闹得很不愉快，对张的一些主张和做法本不以为然。他听了这些议论，回京与袁大总统谈话时偶尔提起，不承想却引出袁世凯一番激愤的议论，举出张之洞的多种过错，将其大大贬低一番，并且叫道：“南皮竖儒，今犹为人引重耶？”袁世凯为何这么激动呢？因为他认为自己是维新的大功臣，练新军、派学生出洋、编印教科书是他在北京直隶的功劳，正得天下风气之先。张南皮做过的几件小事，根本不值得一提。袁世凯一口气讲了三刻钟，唾星四溅，把章太炎对这位“中国的华盛顿”的幻想打破不少。
后来，袁世凯的大儿子袁克定给章太炎一封信，讲佛法，说什么：“夫人人皆有佛性，则人人可作如来，然人人可作如来，而人人未有佛性，则法施不如财施明矣。”章太炎因此明白了，袁家的治国方略毫无信义可言，只是一个利字。遂决心辞去顾问之职。
聚合中文网 阅读好时光 www.juhezwn.com
小提示:漏章、缺章、错字过多试试导航栏右上角的源