导弹快艇的主要武器是导弹，艇上装有对舰导弹2枚至8枚，它们是一种巡航式舰对舰导弹，外形像飞机，弹体上有翅膀，尾部有尾翼，用来对付水面航行的军舰；有的导弹快艇装备有舰对空导弹，用来对付空中目标。
导弹快艇上除了装备导弹武器外，还装有舰炮，通常艇上装有两门舰炮，主要用于自卫。
大型的导弹快艇还装备有鱼雷、水雷、深水炸弹，还有搜索探测、武器控制、通信导航、电子对抗和指挥控制自动化系统。
在第三次中东战争中，埃及海军用苏制“蚊子”级导弹艇击沉了以色列2500吨级的“埃拉特”号驱逐舰。这是海战史上首次导弹艇击沉军舰的战例，它也显示了导弹艇的作战效能。
在第四次中东战争中，以色列的“萨尔”级和“雷谢夫”级导弹艇，成功地干扰了埃及和叙利亚导弹艇发射的几十枚“冥河”式导弹，使其无一命中；同时使用“加布里埃尔”式舰对舰导弹和舰炮，击沉击伤对方导弹艇12艘。
这是导弹艇击沉同类艇的首次战例，它也显示了导弹艇和其他舰艇向电子战能力方向发展的趋势。
这些海战的经验引起了各国海军的重视，于是竞相发展导弹艇，增强它的电子干扰和反电子干扰能力。至20世纪80年代初，已有约50多个国家拥有各型导弹艇750艘。
我国研制的“红箭”级导弹艇装备的雷达及电子设备并不很多，但大多是新型装备，不仅体积小、性能先进，而且可靠性、探测性能及抗干扰能力都有了很大提高，这使“红箭”级导弹艇除具备较强的对海探测能力外，还具有很强的对空探测及电子战能力。
面对信息化战争的新形势，导弹艇要换装新型雷达、数据接收系统和更新导弹，同卫星、无人机等监视装备相结合，以提高搜索追踪目标和精确打击的能力。
延伸阅读
导弹艇具有以下特点：吨位小，排水量小，具有很好的隐蔽性，可对敌舰进行突然袭击；航速高，机动灵活，续航能力在500海里至3000海里；战斗威力大，导弹攻击距离远、命中率高。
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