这个事件是萨仑的斤为亦都护时期的一件大事，史载“宪宗（蒙哥汗）有慊（怨恨、不满）于太宗（窝阔台）子孙，凡太宗旧人在畏兀儿者，缘此斥逐殆尽”。表面上看，是因为佛教徒与伊斯兰教徒之间的冲突和矛盾，背后却隐藏着皇室之间的矛盾，由于萨仑的斤亦都护之位是由乃马真皇后所封赐，蒙哥汗也就将他视为窝阔台系的势力，借助于宗教之争将他杀掉。就这样，蒙古皇室的矛盾波及到了高昌回鹘境内。
玉古伦赤的斤卒后，其弟马木剌的斤继承亦都护之位。马木剌的斤受到了蒙哥汗的重用，曾经率领探马赤军万人之众，跟随蒙哥汗攻打南宋的合州（今四川合川）。南宋为了抵抗蒙古军队，在合州附近的钓鱼山建立了新城，马木剌的斤在帮助蒙哥汗攻打钓鱼山的时候，立下了功劳。钓鱼山久攻难下，蒙哥汗也就是在这次钓鱼山之战中驾崩的。
战后，马木剌的斤返回火州，之后不久，就去世了。蒙哥汗的弟弟忽必烈即位之后，蒙古的汗位之争愈演愈烈，忽必烈的弟弟阿里不哥于哈喇和林自立为汗，由此产生了南北廷对峙的局面，阿里不哥与忽必烈进行了五年的斗争，最终还是投降了忽必烈。另一方面，窝阔台系的海都与察合台系的八剌进行了联盟，共同与忽必烈对抗。八剌死后，其子都哇又与海都结盟，在西北地区展开斗争。在这个过程中，高昌回鹘受到了极大的冲击，最终不得不由亦都护家族率领其部众走上了东迁永昌之路。
1266年，忽必烈任命马木剌的斤的儿子火赤哈尔的斤继承了亦都护之位。由于海都、帖木迭儿在西北地区带来了诸多战乱，高昌回鹘辖地的人民也受到了战火的影响，四处逃亡，于是，忽必烈下旨命令亦都护招抚畏兀儿流民百姓，对那些流散到蒙古西北宗王及近戚境内的高昌回鹘的子民，也要予以遣返。就这样，高昌回鹘的民众终于又聚集到了高昌。
其后，察合台系的都哇及其弟卜思巴发动了叛乱，直接威胁到了高昌回鹘的安危，大臣阿台不花跟随亦都护火赤哈尔的斤极力平定叛乱。当时高昌回鹘的国都在别失八里，由于都哇等人的攻击，他们不得不迁到了火州。来到火州之后，亦都护下令加固城墙，疏浚护城河，高昌回鹘举国上下团结一致，坚守城池，誓与叛乱者斗争到底。
1275年，都哇、卜思巴率领十二万大军包围了火州城，想让亦都护交出这座城池。都哇等人声称：“阿只吉、奥鲁只这些宗王曾经率领了三十万军队，都未能抵挡住我们的进攻，你们仅仅凭借这座孤城就能抵抗住我们强大的进攻吗？”亦都护火赤哈尔的斤义正词严地说道：“常言道，忠臣不事二主，我生以此城为家，死也要以此城为墓，我是坚决不会服从你们的。”就这样，火州城被都哇的大军包围了六个月之久，亦都护仍然不与敌人和解。
然而，当时的元朝军队为何没有前来支援呢？从1274年开始，忽必烈就将主要精力用于攻打南宋，无暇专门增援高昌。另据考证，当时忽必烈勉强派出了一支援军前来增援，但在途中遇到了叛军，最终未能够如期增援火州，没能为亦都护解决燃眉之急。
经过六个月的围攻，都哇也感到不耐烦了，他写了一封信给亦都护，主动请求议和。都哇部下将信绑在箭上射入火州城中，火州城的人们拾到信后，立即呈报给了亦都护。信上说：“我等也是太祖皇帝成吉思汗的子孙，你为什么不选择归附于我呢？先前，我们蒙古王室的公主也下嫁于你们的先辈，如今，如果你能够将你聪明漂亮的女儿嫁给我，我就下令撤兵，我也将设宴庆祝，并将与你们永远和好。不然的话，我们将快速发动猛攻。”
火州城内的百姓久被围困，知晓了信中的内容之后，非常高兴，官员们也集中起来向亦都护建言：“我们已被围困半年之久了，现如今，城中的粮食也快没了，大家都已无力再抗争下去了，如果都哇再继续攻打，我们大家都要共同覆亡啊，为了解除危难，您还是接受他们和解的请求吧，还望您为国家和人民的利益大发慈悲啊！”亦都护深明大义，对众人说道：“在这危急的时刻，我怎么会舍不得用一个女儿来拯救人民呢？但是我终将不会与都哇等人相见。”亦都护将自己的女儿也立亦黑迷失别吉交给了都哇，火州城的人们使公主坐在一个厚厚的垫子上，并用绳索将她连同垫子坠于城下，交给了对方。随后，都哇就兑现了诺言，下令撤兵。
对于亦都护及其家族来说，面对骨肉分离，他们的内心可能充满了愁怨，在为己与为民的选择上也存在着矛盾，关于这些，史书中没有记载，我们只能凭借想象力去揣测。我们知道的是，火州的普通老百姓交口称赞亦都护献出公主的举动，并真诚祝愿亦都护之美名流芳百世。
忽必烈听说了火州之围一事之后，为亦都护的壮举感到高兴，火赤哈尔的斤入朝觐见忽必烈，忽必烈对他的功劳进行了嘉奖，对他说：“我已知道了你的英勇事迹，你没有忘记将你祖先的光荣传承下来啊！”又将王室公主、贵由的女儿巴巴哈尔嫁给了他，赐给他十二万宝钞以赈济百姓。有一天，忽必烈在宫中与黄金世系的太子谈话时，说道：“做官之人，无论是谁，都应该向火赤哈尔的斤那样对国家忠心不二。听说远出的五个的斤中的一个（雪雪的斤）去平原未回，我把此事一直放在心上，今后要把他作为我们黄金家族的成员，你们要以兄弟之礼待之。”雪雪的斤曾奉忽必烈之命镇守云南，在朝中官至缅中行省左丞相。
火赤哈尔的斤由朝中返回到了火州，将封赐的宝钞和其他的物品分发给遭遇到灾难的畏兀儿人民。1280年，由于火州已经荒芜，亦都护策划将都城移居到火州东南部的哈密力（今哈密）。当他们正在此地安营扎寨的时候，兵力很少，此时，一支北方宗王的军队忽然来袭，火赤哈尔的斤率领部众竭力抵抗，但由于寡难敌众，火赤哈尔的斤最终在此役中战死了。
火赤哈尔的斤的战死，无疑极大地打击了亦都护家族。由于身处于蒙古西北藩王的各支势力之间，其辖地要经常面临战火的纷扰，人民无法安居：先是将都城由别失八里迁徙到了火州，而火州又遭遇到了半年的围困，正欲将都城迁至哈密力之时，却又遭受到了更大的灾祸。处于夹缝中的高昌回鹘，已经难以在故地维持生存了。火赤哈尔的斤死后，朝中大臣决议随同王族举国迁徙至内地，由此，高昌回鹘的畏兀儿人开始了迁徙。1280年是高昌回鹘历史上的一个重要的转折点，从此以后，他们就将踏上另一片土地，开始新的生活。
火赤哈尔的斤去世之后，其子纽林的斤尚年幼，众人谋划好之后，纽林的斤与畏兀儿部众上下三四万人开始向东迁徙，准备入大都觐见忽必烈。在途中，他们历尽艰险，经过了长途跋涉，驻扎在了一个叫永昌的地方。永昌位于现在的甘肃省武威市境内，原为窝阔台之孙、阔端之子只必帖木儿的自筑城池，后来元朝在此设永昌府、永昌路。只必帖木儿职位丧失之后，永昌城一直空置，这就为畏兀儿人落居此地创造了机会。
当他们一行到达永昌的时候，“相其土地沃饶，岁多丰稔，以为乐土，因定居焉”，因为土地富饶，常年五谷丰登，因而断定该地非常宜居，于是畏兀儿部众就选择在这里定居了下来。纽林的斤要继续前往大都觐见忽必烈，民众则留在了永昌。
到达了朝中之后，年轻的纽林的斤奏请忽必烈，请求发兵北征以替父报仇，忽必烈很欣赏他的雄心壮志，赐给了他大量的金币，并将窝阔台的孙女不鲁罕嫁给了他。不鲁罕去世之后，又将她的妹妹八卜叉嫁给了纽林的斤。当时皇帝下旨，要向河西地区出兵，所以，纽林的斤自元廷返回之后就留在了永昌，等待着北征大军的到来。恰逢吐蕃脱思麻叛乱，忽必烈诏令纽林的斤率领畏兀儿人组成的探马赤军，与部分蒙古军队一起，共计万人，安抚吐蕃宣慰司。纽林的斤凭借威德镇压了叛乱，当地吐蕃人民得以安居乐业。
迁居永昌的时候，纽林的斤尚无亦都护称号，此时，元武宗将他召还，于1308年任命他为亦都护，使他能够像从前一样管理畏兀儿人民。元仁宗的时候，又封他为高昌王，设置王傅之官，赐给纽林的斤驼纽金印：高昌王印用于内郡和汉地，亦都护王印用于其所管辖的畏兀儿之地。纽林的斤即位为亦都护、高昌王后，曾经发兵火州，收复了故都。
1318年，纽林的斤去世，他有两个儿子，帖木儿不花和篯吉，帖木儿不花在元武宗年间就在朝廷中做事，侍奉过皇太后，又被授予中奉大夫、资善大夫。其父去世之后，他前往永昌奔丧，并请求将其父的王位让给叔父钦察台，但钦察台坚决不同意，他也就此继任为亦都护高昌王。他多次统领军队，镇守过襄阳。为官之时，曾经有一位官员对帖木儿不花很嫉恨。后来这位官员因其他事情犯下罪责，皇上下诏处死他，但帖木儿不花为他求情，认为他尽管确实有罪责，但罪不至死，听闻此言，皇上就免去了他的死罪。因而，他人都很佩服帖木儿不花的雅量。他在多朝担任官职，先后担任过开府仪同三司、上柱国、中书左丞、太子詹事、御史大夫等职，直到元顺帝至正元年，即1341年，才免去了官职。
由于帖木儿不花牵涉进了元朝皇室复杂的政治斗争中，1351年，有人向丞相脱脱诬陷帖木儿不花谋害大臣，脱脱上书元顺帝，诬杀了帖木儿不花。在世之时，帖木儿不花将亦都护、高昌王之位让给了他的弟弟篯吉，篯吉后来又将王位让给了弟弟太平奴，太平奴去世之后，王位由篯吉之子月鲁帖木儿继承，月鲁帖木儿之后，其子桑哥继承。至桑哥即位的时候，亦都护高昌王已经是一个空爵，高昌回鹘已经名存实亡。关于最后几任亦都护高昌王的事迹，史书中记载较少，可以肯定的是，纽林的斤之后，亦都护家族成员多在内地为官，为元朝服务。
关于亦都护家族后裔的情况，1949年以后，研究者通过走访调查，在武威地区探得一些蛛丝马迹，发现亦都护王族后裔更姓为张姓、杨姓。他们仍然信仰佛教，在生活习俗上已与汉族基本无异。至明清之时，亦都护家族的后裔并没有遭受到毁灭性的打击，清朝的时候，武威著名学者张澍前往舅氏家的张府拜访时，曾见到其舅家仍然供奉着元朝亦都护家族数十幅名将的画像，在调查中得知，这些画像，有一部分甚至保存到了1949年之后。据张澍记载，张氏家族于嘉庆年间已经衰败不堪了。
在元英宗至治年间（公元1321－公元1323年），帖木儿不花仍然率领在永昌的军队，治理高昌回鹘旧地，但在泰定帝年间（公元1324－公元1328年），帖木儿不花被元朝召还，从此畏兀儿之地归入了察合台汗国。至此，高昌回鹘旧有领地不再为亦都护家族掌控，这也可以说是高昌回鹘覆灭的一个标志。桑哥之后，我们所知的亦都护家族世系中断，这可以算是高昌回鹘国覆亡的另一个标志。
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