回到深圳，他人看上去仍然几多疲惫。他以前就说过，深圳是个令人紧张的城市，一闻到空气，就紧张。而面对教育部与深圳市教育局的双重压力，他的紧张度可想而知。
这是非常重要的会议，市里决策层领导也出席了。朱清时还是要拼力争取，他要说清楚：为什么不能够让试验班的学生参加全国高考。他啼血般倾诉，却像一块石头用力扔进水中，而水面并没有溅起浪花。领导还是坚持按教育部文件办，并责成他动员试验班的学生全体参加今年的高考。他没有执行。他说，一个教育工作者，对学生言之凿凿，南科大自主招生，自授文凭，不参加全国的高考。他不能在学生面前食言。这个动员工作，他不能去做。他在最大限度地维护着信念与自尊。他不能自毁名声，自毁全国人们都在关心的高校改革试验。
领导问他：你们学校谁负责学生工作？他说了一位副主任的名字，于是，当即有人通知这位副主任到场。
副主任到场时，看到朱校长面无表情地坐在那里。领导对副主任下达了指示，让其动员学生参加高考。这样一块烫手的山芋落到了副主任手上，又不能不接，可接了之后，却怎么处理？
这个时候的南科大是最脆弱的，多么需要深圳政府方面的支持！深圳要一步到位办一流的研究型大学，你就必须掌握自主权，而你要是坚持不住，退回到教育部的规范中，那你的豪华别墅猴年马月能建成？朱清时由此更加强烈地体会到行政化的危害。
散会后，朱清时一个人离去，像只孤雁。
随后，深圳的相关领导到南科大召开高考动员大会，全校师生都要求参加。校方负责做学生动员工作的副主任，跟上级保持一致性。副主任是2007年就到南科大来的，经历了南科大发展的全过程。在副主任看来，南科大既然已经到了生死攸关的关口，还是应该缓解一下，希望把负面效果降至最低，选择瓦全，而不是玉碎。这跟朱校长是不一样的。
市里面确实对此事够重视了，一位副书记亲自坐镇南科大，现场办公。说成督阵也未尝不可，而此时的学生们发现唯独少了他们的朱校长。
官方动员学生参加高考，没有声色俱厉，而是好言相劝，一切都是为了学生着想，为了学生健康发展。他们对学生说，参加高考只当作他们学校内部的一次考试，走一个程序，及不及格没有关系，不计成绩，不排名次，也不公之于众。考试成绩只作参考，不会对同学有任何影响，对他们录取率是100％。网民称“伪高考”或“被高考”。
新华报业网有篇文章《45名南科大学生参加高考就变“合法”了吗？》很耐人寻味。文章写道：“45名南科大学生不参加高考，则不‘合法’，可是，如果这次他们参加高考，就合法了吗？我们同样可以根据教育部的现行规定提出质疑。”
试验班学生身份是高中生还是大学生？按教育部《普通高等学校招生工作规定》，在校大学生不得报名参加普通高等学校招生全国统一考试。南科大首届试验班今年3月1日开学。教育部发言人也予以表态，等于认可他们是大学生了。那为什么大学生还要参加高考？
既然参加高考，那你试验班学生如何报名？教育部《普通高等学校招生工作规定》，“申请报考高校的所有考生，须在户籍所在省（区市）高校招生委员会规定时间地点报名。”那么这些来自13个省的学生回当地报名了吗？广东省高考报名早已结束，他们如何报名？根据《关于做好广东省2011年普通高校招生统一考试报名和建档工作的通知》（粤招201024号），报考条件要求是具有广东常住户口的居民。并且特别明确：“高中阶段户口由外省迁入我省的考生，必须回户籍所在地报考”。组织45名学生在南科大设考场是文件所不允许的。何况，他们参加高考，就能被南科大“合法”录取吗？南科大不在教育部今年公布的2011年具有普通高等学历教育招生资格的高校名单中，因此不能列入招生计划，这些考生即使参加了高考，也只能在统招计划内填报志愿。他们填报哪所大学都行，唯独无法填报南方科大。那么，深圳方面向学生许愿的100％录取如何保证？又如何解释诸多疑点、诸多违规违法？
试验班的45名学生，面对高考之压力时，经历了人生最重要的考验。有个学生说，老师在动员他参加高考时说，朱校长是同意让他们高考的。他不相信，老师却说，校长是默许的。并解释说，校长同意文件精神，都签字了。学生困惑：既然校长同意，为何采取消极的回避态度？他是这样理解他们的校长：压力太大了，可能是人在江湖，不得不为之。但，他坚信校长内心是不会希望他们去参加高考的，他说，他们绝不会让校长失望。
这是一个多么难的社会
核能辐射，大地动荡
这是一个多么肤浅的社会
人心浮躁，欲望膨胀
我们很难想象
在创业之都深圳一隅
有一条学苑大道
眷顾着中国脆弱的梦想
这是中国人为自己设下的圈套
学生挥洒着汗水、青春、激情
只为一刻，却付出十年寒窗
我们奇怪：为什么分数可以代表一个人
我们彷徨：经历煎熬却常常失去思想
天生我才
我们不安于平庸
爱国爱人苍白的呼喊在心中回荡……
这是2011年的南科大，在“五四”青年节的晚会上，学生们自编自演的诗朗诵。全诗很长，这是节选。演出中，台下有的老师哭了，同学也哭了。有人说是老师先哭的，也有人说是同学先哭的。
南科大举步维艰，前程叵测。从动员会召开到6月7日高考日，有一个月的时间。这段时间，是最令南科大纠结的。
家长们有自己的QQ群，这个最便捷的空间，将分布在13个省份的家长们紧密联系在一起。以深圳方面的家长为主，他们更有知情条件。因此，他们每每是这个群里最活跃的成员。
说到这个QQ群，我要在这里插入另外一个重大事件，几乎是与“被高考”同时出笼的：深圳市委组织部发出在全国公开招聘正局级副校长的通告。这个QQ群就如热油锅里撒了把盐。
家长们在五一节期间，涌入QQ群，争先恐后表态，对深圳组织部招聘两名正局级副校长的这一做法，表达了强烈的不理解。热议了几天后，家长们写了一封给教育部的《南方科技大学首届教改试验班学生家长恳请书》。千言书中，家长们真情表达：
“我们南科大首届试验班全体家长呼吁和恳请国家教育部：
第一、指导和要求深圳市相关部门慎重对待南科大管理层的选拔，建议副校长由校长提名并经过特定的专家委员会审查后聘任，并赋予创校校长考察和解聘不合格副校长的绝对权力。”
还有两条，不想再引述了。他们竟寄希望于教育部矫正深圳市。他们还不知道教育部已经下达了文件：明令他们的孩子参加今年全国统一高考！假如这些家长当时知道了，他们还会熬夜写下这种信吗？
听说家长们如期找到了朱校长。朱校长并不像他们那么紧张，他平和地说，开始，也为这件事深感诧异。为此，他专门去了一趟组织部。组织部门按深圳市选拔干部的一般规则，如法炮制了招聘启事，却忽略了南科大“去行政化”的这一办学根本原则。朱校长等于当场给组织部的同志讲述了南科大的“去行政化”的意义所在，以及目前的困难处境。他说，去行政化，是办好大学的关键。比如：派两位管行政的副校长的程序，应该由校长先提名，然后，理事会研究，最后才提交给市委方面把关批准。而现在，程度完全倒过来了，与南科大初衷相悖。这等于说，南科大一边在喊“去行政化”，一边又在搞行政化的这一套举措，社会影响可想而知。
组织部门听明白了朱校长的话，当场表示积极支持南科大。
在处理这件事时，朱校长还是抱有乐观态度的。他认为在学校与深圳政府方面出现的一些分歧，是沟通不善的原因。他感觉需要有人跟市政府方面及时沟通。但是，除了他之外，学校里又有谁能够具备这个沟通能力呢？到这些政府部门，如果没有一定的资历，没有校长或院士的头衔，人家会认真听取你的“基础知识”吗？所以，朱校长感叹：他还需要拿出很多精力和时间，去应对类似的沟通工作。
家长们见朱校长这样解释，也便释然了。然而，接下来的事情，他们仍然看不懂了：行政化式的正局级副校长招聘并未因朱校长的“沟通”而改变方式，仍然按照官场的那个套路，一路操作下去。2011年5月26日《深圳特区报》A4版很醒目的标题：“关于深圳公开推荐选拔职位差额考察对象《公示通告》”。开篇写道：经深圳市委常委会研究决定，乔从丰等人被确定为南方科技大学（筹）2个副校长职位差额对象。
家长们掌握的情况是，9名候选人将拿到市委常委会上，最终确定两人。他们要将这已经确定的两人再交由南科大，让朱校长提名，再经理事会讨论通过。领导已确定了人选，而校长提名、理事会讨论，只不过是走个过场罢了。何况，南科大的理事会，至今没有成立起来。而两位正局级副校长人选，也未到位。这件事说到底，是与朱清时的去行政化的南科大，形成鲜明反差。
对家长们而言，刚刚熬过了正局级副校长风波，又遭致教育部高考的迎头巨浪！他们情绪异常强烈，反对之声不绝于耳。他们有的到学校来了，十分激动。学校出面动员学生高考时，也在主动联系家长们。当然，家长们并非都是清一色完全拒绝高考，也有个别家长同意高考，但是，家长们无法左右他们的孩子，孩子们倒是更坚定地维护着南科大的改革方向。
一场大是大非，水火不相容的对峙，在南科大形成。这个对峙，牵动了中国，也牵动了世界。美国《科学》（Science）杂志非常关注南科大，称其为中国高校改革的风向标。其中一篇文章是对朱清时的专访：
《科学》：南方科技大学将在什么方面与中国其他大学不同？
朱清时：我们将废除等级，我们称之为去行政化。
《科学》：这将如何起作用？
朱清时：高等教育的主要问题在于官僚力量。许多教授现在追求的是行政级别而不是学术成就。如果你爬上了高级别，你就能得到金钱、汽车和研究资助。这就是为什么中国大学丧失了生命力。
朱清时最后谈到可能遇到的风险，是学生可能没法获得由教育部签发的毕业证书。人们正期待一所大学去挑战教育系统，并显示一种有效的改革途径。“我已准备好做尝试真正教育改革的第一人。”
这是2009年11月20日刊发的。现在呢？接连发生的事情，是朱清时无法预测的。对于《科学》而言，如何感知风雨飘摇中的南科大，这个风向标是往前行还是往后刮，眼瞅到了揭晓之时。
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